白花泡桐DREB转录因子基因的克隆与表达分析

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白花泡桐是我国特有的速生丰产树种,具有非常高的经济和生态价值。利用基因工程技术对白花泡桐进行品种改良,可以弥补常规育种方法的不足,加快白花泡桐在遗传育种方向的发展。在白花泡桐的生长过程中,干旱、盐害、极端温度等环境胁迫因子能够严重影响其生理活动以及生长发育。植物通过转录因子调控相关基因表达,可以在转录水平上对自身生理代谢和生长发育达到调节作用。DREB转录因子在植物中广泛存在,通过参与调控各种功能基因的表达,来提高植物的抗逆性。本研究在白花泡桐中克隆到白花泡桐的Pf DREB2基因,并对其进行了生物信息学分析,该基因具有DREB基因的基本特性。主要研究结果如下:1、本实验材料为白花泡桐叶片,根据DREB基因DNA结合域的保守区域设计并合成简并引物,扩增出DREB基因的同源片段,根据此同源片段设计特异性引物,通过RACE技术获得白花泡桐DREB基因全长序列,通过氨基酸序列比对发现,此基因为DREB2转录因子基因。2、分别以白花泡桐genomic DNA和c DNA为模板PCR扩增,通过对扩增的产物的序列分析发现,该基因不含有内含子。3、该基因c DNA序列全长1049bp,其完整的开放阅读框为648bp,能够编码215个氨基酸。该基因可编码的蛋白含有一个由64个氨基酸组成的典型的AP2/EREBP结构域。该结构域的第14位和19位分别为缬氨酸和亮氨酸。其氨基酸序列含有丝氨酸富集区和谷氨酰胺富集区,C末端含有一个酸性活化域。该蛋白可能定位于细胞核。BLAST比对发现该基因与芝麻的DREB基因相似性最高。4、通过实时荧光定量PCR分析白花泡桐Pf DREB2基因在干旱、高盐、低温、ABA诱导下的表达变化发现,该基因在不经过任何胁迫处理的条件下几乎不表达,在高盐和低温胁迫诱导后能够迅速表达,但表达量和表达量的变化程度没有干旱胁迫时高。在干旱诱导下Pf DREB2基因的表达量最高,表达量变化的程度最大,其对干旱胁迫更加敏感。表明在白花泡桐遭受该逆境胁迫时,该基因具有一定的调控作用。白花泡桐Pf DREB2基因在ABA处理下几乎不表达,说明该基因不受外源ABA调控。
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