论文部分内容阅读
随着分子生物学的发展,传统分类学打破了久已停滞不前的困境,开始迈入分子水平。2003年DNA条码概念首次提出,至今DNA编码已经被证明是一个行之有效的生物鉴定手段。它将对保护生物学、生物多样性研究的发展起着重要的作用,在解决鉴定问题的同时,也会给构建系统发育树提供足够可靠的“树叶”,从而推进生物进化历史的研究。熊科属于脊索动物门、脊椎动物亚门、哺乳纲、食肉目。熊科的分化间隔时间相对较短,是一个快速的进化辐射和物种形成事件,其物种的发育关系一直存在着争议。由于人为的捕杀和物种栖息地的破坏,熊科动物的数量急剧减少,其物种均被列为国家级濒危保护物种。为了解决熊科物种系统发育关系及其进化和分类,同时为打击犯罪,保护和管理熊科物种提供技术支撑。本文使用DNA编码技术对熊科动物进行编码,并结合12SrRNA和Cytb基因构建系统发育树。本研究获得了32条亚洲黑熊的COI序列,5条亚洲黑熊和棕熊的Cytb序列,5条亚洲黑熊和棕熊的12SrRNA序列。分析得出熊科物种COI、12SrRNA和Cytb三种线粒体基因,其碱基组成存在偏倚性,A+T含量要高于G+C。熊科物种发育关系研究得出,支持棕熊和北极熊是姐妹群关系,美洲黑熊与棕熊和北极熊关系较近与亚洲黑熊关系较远；支持亚洲黑熊应独立分为亚洲黑熊属Selenarctos,不属于熊属Ursus,棕熊、北极熊和美洲黑熊归于熊属Ursus;马来熊与美洲黑熊关系较近与懒熊关系较远,懒熊比马来熊分化要早；大熊猫和眼镜熊是熊科分化较早的物种；小熊猫不属于熊科。支持马熊是棕熊的一个亚种,不支持将其单独划分成种。对于物种水平的研究,COI基因构建的系统发育树与合并数据集得到的结果有较高的一致性；对亚种水平的研究,COI基因作为DNA条形码比12SrRNA基因和Cytb基因更为有效。对于COI基因、12SrRNA基因和Cytb基因,棕熊和北极熊种内序列分歧与种间序列分歧差异很小,在进行棕熊和北极熊的物种鉴定时,靠单独的序列差异和建树方法略显不足,需要再结合其它分析方法加以判定。