改革开放以来,伴随着我国经济社会的快速发展,各种运输方式的供给总量迅速扩张,同时各种运输方式的协调发展问题日益凸现出来,特别是在资源、环境、生态等约束条件的压力下,尤为突出。因此,发展综合交通首先要考虑的就是各种运输方式的协调发展问题,其本质是综合运输系统运输结构优化问题。本文结合我国综合交通发展存在的问题和面临的形势,以运输结构为研究对象,从方式角度研究综合运输系统结构问题,旨在为运输结构的调整提供指导。在交通运输的发展历史中,综合运输系统中的某一种运输方式交替占据主导地位,总体的运输结构处于不断的演化发展之中,以适应经济和社会发展的需要。自组织理论作为解决复杂系统的有效工具,为我们研究综合运输系统结构演变提供了有力的基础理论和方法论思想。本文首先运用自组织理论对综合运输系统的耗散结构特征进行分析,阐述了运输结构演化的自组织和他组织机制,并对运输结构演化进行了系统描述；在此基础上从社会经济发展、科技进步、宏观调控三个方面对影响运输结构演变的关键因素进行了分析；然后引入运输需求结构变量,通过探讨运输结构与需求结构的变动关系分析了运输结构调节的类型,进而阐述了运输结构优化的内涵及重要性；根据运输结构的优化分析引出运输结构协调性评价问题,构建了反映运输结构协调性的评价指标体系,在协调性评价过程中对主成分分析方法进行了改进,运用灰主成分分析方法进行各种运输方式的发展水平计算；最后,以湖北省为例,对湖北省对运输结构的协调性进行了评价。研究成果为运输结构调整提供了理论依据和实践指导。