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柳枝稷(Panicum virgatum L.)是分布于中美洲和北美洲的一种多年生草本植物,因其具有丰富的纤维素含量,极好的耐受性,较高的乙醇转化效率等优点,被公认为替代粮食生产燃料乙醇的理想能源作物。然而,柳枝稷存在种子休眠严重、幼苗发育慢和苗期生长缓慢的现象,导致其在田间与杂草的竞争中处于劣势,规模化种植较为困难。本研究利用转录组测序技术,分析了发育较快的幼苗与发育较慢的幼苗转录组信息的差异,以期为筛选与幼苗发育速率相关的差异基因提供参考;同时,采用不同的贮藏温度组合处理柳枝稷种子,通过比较发芽率、发芽指数和发芽势,解析不同的贮藏温度对柳枝稷种子萌发的影响。取得的主要结果如下:1.利用转录组测序技术,对来源于同一单株的发育快的(Rapidly established,re)和发育慢的(Slowly established,se)柳枝稷幼苗进行转录组信息的对比。在对60 G测序数据的de novo组装中,共得到了143,357个平均长度为1,174碱基的Unigenes,并对Unigenes进行注释。在re幼苗和se幼苗的转录组信息对比中,共得到了125个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中,94个差异表达基因在se幼苗中表达上调,31个表达下调。对差异基因的GO(Gene ontology)分析表明,富集最多的GO注释是“生物过程的调节(Regulation of biological process)”,“色素(Pigmentation)”和“对刺激的响应(Response to stimulus)”;差异基因中被注释为转录因子的基因有38%属于bHLH家族。在差异基因的功能注释中发现,赤霉素(GAs)生物合成途径中的关键酶——贝壳杉烯合酶(Ent-kaurene synthase,KS),在re幼苗中表达上调;对re幼苗和se幼苗中GAs含量的测定结果表明,re幼苗中GAs水平高于se。通过对差异基因的分析,柳枝稷幼苗不同的发育速率可能是由植物激素生物(如GAs)合成和信号转导的差异,叶绿体蛋白质的发育程度,代谢能量分配的差异,以及对环境条件的不同响应所引起。2.通过研究不同贮藏温度处理对柳枝稷种子萌发的影响,结果表明,柳枝稷种子发芽需要一定的温度积累,若贮藏温度为25℃,则贮藏时间为90-120 d对种子的休眠的破除效果较好;若贮藏温度为30℃,则贮藏时间为75-105 d对种子的破除的效果较为理想。柳枝稷种子不仅存在生理后熟,还存在形态后熟,这种现象是导致其深度休眠的重要原因,也影响柳枝稷播种后生长发育。