自从工业革命以来,创新成为决定一个国家发展和腾飞的重要力量。而中国经济高质量发展的背后同样离不开创新,创新为经济发展提供新的动力。在区域创新系统中,关键是将科技创新发展与经济效益、绿色发展紧密相连,协同发展,这样才能提高科技创新成果在绿色经济发展中的转化效率。另外,为了解决能源消耗大、环境污染严重等现实存在的问题,在发展经济的同时也要兼顾绿色发展。区域绿色创新发展可以大大减少由发展带来的环境和污染问题,走“绿色”发展的可持续道路,这对于整个国家具有重要的现实意义。本文综合了SBM模型和耦合模型,基于创新驱动角度将区域绿色创新系统分为科技创新子系统、经济效益子系统和绿色效益子系统三个紧密联系的子系统,运用考虑非期望产出的耦合SBM方法,选择除香港、澳门、台湾和西藏以外的30个省、直辖市和自治区的相关指标数据,研究中国各省份从2010年到2016年的省际区域绿色创新系统整体效率和各个子系统的效率值,进行区域绿色创新系统效率分析。然后基于耦合SBM模型测算区域绿色创新系统内部的耦合协调度,通过耦合协调度二维矩阵图,将30个省份划分为“明星型”、“中庸型”和“落后型”三种类型,针对不同类型省份的发展,得到以下结论:(1)对于科技创新子系统、经济效益子系统和绿色效益三个子系统的效率值水平,全国范围内不同地区表现出不同的水平,且地区差异较大,整体呈现从东到西逐渐递减的分布趋势。(2)根据耦合协调度水平,我国区域绿色创新系统整体处于中(低)度协调中度耦合水平。在耦合协调度二维矩阵图中,除河北省外,大部分东部省份属于“明星型”和“中庸型”,而中西部省份除了陕西和吉林等省份外,多数属于“中庸型”和“落后型”。(3)我国在绿色效益发展上成绩显著,环境污染系数平均值由2010年的1.80下降到了2016年的0.92,表明我国现阶段的发展已经充分认识到绿色创新发展的重要性,在发展经济的同时,对于“三废”排放量的控制也越来越重视。最后针对二维矩阵图中不同象限(类型)省份的发展给出路径提升方法和政策建议,最终提高区域绿色创新系统效率。