人类基因组测序工作的完成使人们可以方便调用任何基因序列,但仅有基因序列并不能解释众多的生物学问题,这要求人们发展一种高通量的技术用于研究基因的生物学功能以及与其他基因相互作用的关系。DNA微阵列技术以其高通量的特点已经在肿瘤生物学的研究中逐渐被采用。由于癌症是源于基因表达谱改变的一种基因疾病,通过DNA微阵列技术研究代表肿瘤发展各阶段细胞之间的基因表达差异将会使人们更好的了解肿瘤的形成和发展过程。前列腺癌是引起西方男性死亡的主要癌症,而且也是最常见的诊断性癌症。通常,前列腺癌变的速度很慢。如果早期发现并治疗可以得到很好的疗效,然而一旦前列腺癌出现转移就很难进行有效治疗和提高病人的生存率。为了解决上述问题,关键是使用预测性标记物找出哪些前列腺癌病人在其有生之年会进一步发展为转移型前列腺癌。转移型前列腺癌经过了一系列的发展过程其中包括正常前列腺上皮细胞内瘤、局部前列腺癌、侵袭性前列腺癌和转移性前列腺癌。前列腺癌的这些发展阶段包括多个分子的改变,暗示这些发展是通过基因表达差异的改变进行的。一旦前列腺癌发展为雄激素非依赖性就意味着这些肿瘤细胞的生长不受控制,这个阶段是前列腺癌病人死亡的主要原因。然而几乎所有的转移型前列腺癌病人起初对抗雄激素治疗都有效果,但是在2年内大部分的病人就对抗雄激素治疗失去应答。基因表达的改变和表观遗传的改变被认为是前列腺癌发展为雄激素非依赖性的主要原因[1-4]。为了研究这种发展过程,我们选择使用微阵列技术来研究高恶性、晚期、雄激素非依赖性的前列腺癌细胞系C4-2和低恶性、初期、雄激素依赖性前列腺癌细胞系LNCaP基因表达图谱差异。获得了以下研究结果:1.选用涵盖18,000多个转录本,代表18,000多个明晰的基因,其中13,000多个为全长基因的美国Affymetrix公司的人类全基因组U133系列芯片,高通量分析了LNCaP/C4-2细胞中基因表达图谱的变化。2.通过Affymetrix、GenBank,dbEST,and RefSeq等网站对Affymetrix芯片数据进行大量的生物信息学分析和文献调研。其中表达量差异在1倍以上基因658个,表达量差异在2倍以上的基因有260个。175个基因在C4-2细胞中