采用文献资料法、问卷调查法、专家访谈法、数理统计法等研究方法,以福建省5所高校高水平运动队为研究对象,对福建省高校高水平运动队运行现状进行研究,研究表明,目前福建省各高校高水平运动队硬件设施普遍处于较好的状态；高水平运动员大体都能达到二级运动员的标准:各高校多采用自己办队的模式；普遍采取招生专业队运动员的招生模式；多数采用集中编班结合分散插班的管理模式；教练员普遍职称较高,以兼职带队为主；各高校领导普遍重视程度不够；各高校面临的最大挑战是经费的匮乏情况,其次是普遍较难争取到全国、省市等比赛机会,运动员的训练和参赛的情况很不理想。在对调查结果统计分析的基础上以动力机制、控制机制、整合机制、激励机制和保障机制这五个方面为切入点,提出符合福建省普通高校高水平运动队运行机制的构建模式。即,从社会、学校和个人三个层次构建动力机制；从目标控制、组织控制、制度控制和人文控制等方面构建控制机制,使各个环节接近发展的高水平运动队的运行总目标；从宏观和微观方面调控外部和内部的机构管理构建整合机制。从成就感、归属感等更高层面构建激励机制；从福建省地区优势、人才优势、项目优势以及市场提供的有力条件等方面构建保障机制。