核酸等温扩增的集成化微流控芯片研究

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fiscar
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
无论是在医学临床还是科学研究中,诊断技术都是医疗卫生领域重要的组成部分。在人类后基因组时代,分子诊断技术的兴起大力推动了生物医学的发展,核酸扩增检测为流行病学研究、传染病控制以及慢性疾病治疗提供了一种快速、灵敏的分子诊断方法。为了满足个体化医疗的需要并为临床医生治疗患者提供可信赖的诊断依据,理想的核酸扩增检测应该满足价格低廉、功能集成化和操作自动化等特点。然而,传统的核酸扩增检测依赖于专业的技术人员操作,是一个耗时费力的过程。微流控芯片,克服了传统诊断检测的缺陷,实现了样品分离纯化、试剂混合、核酸扩增和检测等步骤的微型化和集成化,减少了试剂消耗,简化了操作步骤,在数小时内即可完成多种样品同时检测。本文以病原菌和非小细胞肺癌细胞为研究对象,利用环介导等温扩增在微流控芯片内整合核酸扩增检测过程,实现了细胞特异性检测。论文的主要研究结果如下:首先,本文提出一种基于凝胶的环介导等温扩增(in-gel loop-mediated isothermal amplification,gLAMP)微流控芯片,可用于多种细菌核酸同时检测。芯片由微通道和反应腔室组成,腔室内预装的低熔点琼脂糖和扩增反应试剂使得芯片在4℃下可以长期保存。四种食源性病原菌(大肠杆菌、普通变形杆菌、沙门氏菌和副溶血弧菌)在芯片内的检测限均低至3拷贝/微升。gLAMP芯片不仅可以检测纯化后的细菌核酸,还可以直接检测掺入细菌的血清热裂解物,当血清中掺入一种或多种细菌时,均可以被芯片成功检测。为了将核酸提取与扩增整合在同一块芯片内,并摆脱对泵和注射器等额外装置的依赖,本文在gLAMP芯片的基础上进一步设计了一种纸-聚二甲基硅氧烷(PDMS)杂合芯片。该芯片利用CloneSaver卡实现细菌裂解,核酸分离,浓缩以及纯化。LAMP反应试剂与低熔点琼脂糖混合后预装在PDMS反应腔室内以简化芯片使用步骤。考虑到PDMS自身的形变特性,核酸提取腔室与LAMP反应腔室之间加工有一层PDMS薄膜,芯片使用过程中通过指压打开薄膜上的十字通道从而促使提取的DNA溶液进入反应腔室。该芯片无需任何芯片外样品处理步骤就可直接用于细菌检测,沙门氏菌在该芯片内的检测限达到1.6拷贝/微升。微流控芯片的荧光成像借助于较大体积的昂贵检测设备,难以在资源匮乏地区推广使用。为满足个体化医疗的需要,本文设计了一种新型基于胶体金试纸条的核酸检测纸芯片,利用比色方法可裸眼观察扩增结果。实验过程中将Direct PCR缓冲液加入LAMP反应体系中,无需任何细胞裂解和核酸提取步骤就可以扩增细胞样本的目标基因。针对EGFRΔ745750突变设计特异性的引物,非小细胞肺癌细胞NCI-H1650成功地在芯片内检测出该突变,而对照实验中A549细胞和NCI-H1975细胞则没有检测出该突变。Direct PCR缓冲液的参与虽然简化了样品核酸提取步骤,但是其较高的价格也相应地增加了检查费用。为进一步降低核酸扩增检测成本,同时又将核酸提取、扩增和检测整合在同一块芯片内以适应个体化医疗的需要,本文在纸芯片的基础上进行改进,通过在芯片内嵌入FTA卡实现样本核酸提取,并在纸芯片相应位置粘贴固定装有洗脱试剂的PDMS蓄液槽用于核酸纯化。芯片使用过程中,FTA卡旋转到不同的位置完成细胞核酸检测的各个过程。该一次性纸芯片成功用于非小细胞肺癌细胞单核苷酸多态性的检测,即EGFRL858R检测。综上所述,本文设计了不同功能的环介导等温扩增微流控核酸检测芯片,芯片集成了核酸提取、扩增与检测各实验环节,拥有采样-反馈的完整功能,特异性地检测了多种病原菌和非小细胞肺癌细胞的核酸序列,为个体化医疗提供了成本低廉、制作简单和操作容易的核酸扩增检测平台。
其他文献
<正> 方药:八棱麻(陆英)鲜根一斤,蒲公英一两,甘草五钱。用法:一日三剂,水煎,温服,分多次服下。疗效:本方用于治疗产后发热,恶露多而臭。一般服两剂后热退恶露减少。3~4剂痊愈
期刊
青年肉鸽是指3~6月龄的内鸽,青年鸽的生长发育是否正常。直接关系到种鸽的(生产)品质和生产水平。因此要按其生理特点精心饲养。
《义务教育数学课程标准(2011年版)》中的"四基"是数学课程及其实施的基本目标。基本思想是教师与学生数学素养的重要标识。数学基本思想涵盖抽象思想、推理思想和模型思想,
本文基于最大化贫困减少目标,提出最低生活保障制度分配效果评估的理论框架,运用反事实分析方法,采用2004—2010年福建省农村居民收入分组数据,估算低保转移支付产生的贫困和
特杀(鳗鱼,鳜鱼)功效 本品是最新强力协同作用的消毒杀虫剂,对杀灭车轮虫,斜管虫,聚缩虫,钟形虫,小瓜虫等纤毛虫类有特效;对防治嗜水气单胞杆菌,爱德华氏菌,柱状屈桡杆菌,粘球菌,弧菌等致
以氢化萜烯酯型环氧树脂(HTME)与带活泼氢的(羟基)化合物(二乙醇胺,N-甲基单乙醇胺,二乙胺)反应制备了环氧树脂基多元醇。通过研究不同反应因素对合成反应的影响,确定了合成环氧树脂基
目的探讨在放疗期间对早中期食管癌患者进行自我饮食护理的有效性。方法选择进行放疗的食管癌患者78例,随机分成自我饮食护理组和传统饮食护理组各39例。对自我饮食护理组患
作为企业的新生力军,新生代员工具有许多上一辈不具备的群体特征,而正是这些群体特让他们在工作过程中得到更多的重视和肯定,但是另一方面他们的这些群体特征又被视作是消极
文章采用田野调查的研究方法,采集了老、中、青三代南通人的语音样本进行分析,结果表明,在声母方面,新派南通话的唇齿音[v]摩擦已经不明显;部分定母字上,新派受普通话影响读
杰克·伦敦的信仰复杂并相互矛盾冲突 ,许多伦敦研究者认为伦敦思想混乱 ,无章可循 ,本文试图从伦敦的作品发展过程勾勒出伦敦的思想发展脉络 ,指出在伦敦不成系统且相互矛盾