目标研究三年来海原县新农合基金的运行情况，分析参合农民的疾病经济负担及其影响因素。提出一些减轻和控制农民疾病经济负担的对策和建议。方法利用二步模型法计算海原县三年的疾病经济负担变化，非参数检验的方法单因素分析影响疾病经济负担的因素，采用主成份分析方法分析农民门诊和住院疾病经济负担的主要影响因素。结果（1）海原县新农合基金来源由中央财政补助、省级财政补助、县级财政补助、个人筹资和其它五部分组成。2008、2010和2011年，总筹资金额年均增长速度73.66%。2008、2010和2011年三年间门诊补偿金额所占比例逐年上升，住院补偿金额比例逐年下降，筹资总金额逐年上升，统筹基金年均利用度77.36%。（2）2011、2012年随访调查海原县农民直接疾病经济负担较2009年基线调查，升降情况，降幅为32%，28.69%。2011、2012年随访调查海原县农民间接疾病经济负担较2009年基线调查，升降情况，降幅为19.86%，33%。（3）随着新农合政策调整方案的落实，海原县农民总疾病经济负担情况逐年下降，人均疾病经济负担占海原县农民人均地区生产总值的比例分别为52%、36%，27%。2011年，2012年按居民消费价格指数调整后人均疾病经济负担分别下降31.24%，11.19%。（4）项目实施前后，2011、2012年海原县农民不同年龄组年门诊人次、门诊费用均有下降，变化最明显的是15岁～组，降幅分别为20%，33%和49%，26%。门诊前五位最严重疾病经济负担变化明显的是，呼吸系统就诊人数的变化。从项目实施前的两周就诊人次由164人次，上升到480人次和326人次，疾病顺位由第二位上升到第一位，直接疾病经济负担由10743万元，下降为9326.27万元和8149.71万元。（5）疾病经济负担的影响因素分析：单因素分析，分别从社会人口学角度：性别，年龄，民族，婚姻状况，文化程度，职业，保险类型，收入这些因素对直接疾病经济负担的影响，得在直接疾病经济负担上有统计学差别（p<0.05）的为，年龄、民族、婚姻状况、职业、收入;主成份分析的多因素分析结果分为：门诊标化偏回归系数方程：^y4.757-0.329stdx₁+0.121stdx₂-0.076stdx₃+0.063stdx₄+0.201stdx₅+0.163stdx₆+0.021stdx₇-0.146stdx₈+0.092stdx₉+0.116stdx₁₀+0.652stdx₁1；住院标化偏回归系数方程：^y7.341+0.091stdx₁-0.085stdx₂-0.110stdx₃+0.004stdx₄+0.044stdx₅-0.080stdx₆+0.108stdx₇-0.194stdx₈+0.094stdx₉+0.250stdx₁₀+0.387stdx₁1+0.390stdx₁2结论新农合政策的调整使新农合的资金流向更符合农民就医过程中门诊费用低，但全年费用重的需求，使新农合的资金得到更有效的使用。很大程度上降低了海原县农村居民的疾病经济负担，调整了三级诊疗结构的门诊流向，初步改变了海原县农村居民“小病大看”的就医行为。