本文从建设社会主义新农村的需要出发，从完善基层动物防疫体系的角度上考虑，于2005年2月至2006年8月，对河南省周口市10个县(区)的动物防疫体系进行了问卷、访谈调查，调查内容主要包括动物防疫体系的机构设置，现行动物防疫体系存在的弊端、以及农户对防疫体系因素的采纳等方面进行了较为全面的调查研究，以期能通过对周口市基层动物防疫系统所存在的问题进行全面、系统的了解，进而了解当前我国基层动物防疫体系所面临的问题以及解决的办法。通过本调查研究，发现河南省周口市10个县(区)的基层动物防疫体系主要存在以下几个方面的问题：1、影响防疫工作的观念和心理因素；2、管理体制方面：乡镇兽医站管理体制不顺，兽医管理制度不健全，人事及分配制度不合理；3、队伍建设方面：专业队伍不稳定，专业队伍素质差，技术力量薄弱，兽医防疫技术人员职能错位，技术人员精简过多，民间兽医队伍不稳，专业素质低；4、投入少，基础设施差，有偿服务困难；5、法律法规不健全，法制宣传不够。针对以上这些问题，同时为了更好地发挥基层动物防疫体系的作用，本文提出了相应的建议，概括如下：1、健全兽医防疫制度。逐步建立和完善兽医防疫经费保障机制，实施动物防疫垂直监管；2、加快现代化防疫体系的建立。从以下方面做：从改革兽医体制入手，借鉴国外经验建立重大疫情的扑灭机制，加强基层动物防疫队伍建设，全面实现对规模饲养场的监管与疫情监测，把无规定疫区建设提高到一个新水平；3、强化防疫服务。兽医技术人员要转变思想观念，转变工作作风，主动为养殖户提供优质、高效的服务；4、依法治疫。依法制定重大动物疫病控制的中长期规划，使得动物疫病防治工作有序进行；同时在实际操作中应按国家动物防疫相关的法律法规执行，对所在地区的动物防疫工作应按照规章制度来监督，真正做到落实到基层。