mTORC1基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nofengy
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目的哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)是一种重要的信号传导分子,可通过整合细胞外信号,影响基因转录与蛋白质翻译,在维持细胞生长、增殖、分化和凋亡等功能中起中心调控作用。其中哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1(mTORC1)是mTOR的主要存在形式之一,在以上方面的调节功能中发挥重要作用。mTORC1由mTOR、mLST8、RPTOR组成。研究发现mTOR信号通路中多个相关元素的调控异常都与肿瘤的发生、发展和转移过程密切相关。mTOR通路中的某些基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可能影响mTOR通路活性进而影响肿瘤的发生和发展。本研究探讨mTORC1中8个潜在生物学功能SNP位点(mTOR基因rs2536(T>C)、rs1883965(G>A),mLST8基因rs316(0T>C)、rs26865(A>G),RPTOR基因rs106293(5T>C)、rs3751932(T>C)、rs3751934(C>A)以及rs12602885(G>A))单个或联合作用及其与环境因素的交互作用对肝癌遗传易感性的影响。本研究对帮助阐明肝癌发生的分子遗传机制及发现肝癌高危人群等具有重要意义。方法采用以医院为基础的病例对照研究方法。病例组选自2007年6月—2011年4月期间于广西医科大学第一附属医院和广西医科大学肿瘤医院住院治疗的1048例原发性肝癌新发病例,纳入病例组的患者均为广西壮族自治区居民(居住10年以上),并经临床表现、血清肝癌标志物以及肝组织病理学等检查确诊,既往无其他器官恶性肿瘤史及肝脏转移的,未接受放疗和/或抗癌药物治疗;对照组选自同期于上述医院治疗的1052例非肿瘤患者,并按性别、民族、年龄等与病例组频数匹配。采用调查问卷收集所有研究对象的一般人口学以及相关环境暴露因素资料。采集研究对象外周静脉血3ml,运用酚-氯仿法提取全血基因组DNA。运用TaqMan MGB探针等位基因分型技术对本研究中的8个SNP位点进行基因分型。计量和计数资料分别采用t检验和χ2检验方法进行统计分析。应用拟合优度χ2检验检验对照组中各基因型频率的分布是否符合哈迪一温伯格(Hardy-Weinberg)遗传平衡定律。运用非条件Logistic回归计算各比值比(odds ratios,OR)和95%可信区间(confidence intervals,CI),并分析各SNP位点基因型及其与环境因素的交互作用、SNP位点联合作用与肝癌遗传易感性的关联性。所有数据的统计分析均采用SAS9.1.3统计软件。结果(1)一般人口学资料和环境暴露因素分布情况病例组和对照组人群在年龄、性别、民族等方面差异均无统计学意义(P>0.05)。吸烟者、饮酒者及HBV感染者在病例组所占比例明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.001)。(2)mTOR、mLST8和RPTOR基因多态性与肝癌遗传易感性关系多因素Logistic回归分析发现,经年龄、性别、民族、吸烟、饮酒、和HBV感染等因素校正后,以mTOR基因rs2536(T>C)TT基因型做参比,CT或者CC基因型与肝癌发病风险之间无统计学关联(TC vs.TT:OR=1.02,95%CI:0.74-1.42;CC vs.TT:OR=0.44,95%CI:0.15-1.42);与mTOR基因rs1883965(G>A)位点野生纯合子GG基因型相比较,GA或者AA基因型与肝癌发病风险均无统计学关联(GA vs.GG:OR=1.10,95%CI:0.78-1.56;AA vs.GG:OR=0.35,95%CI:0.04-2.90);与mLST8基因rs3160位点TT基因型相比,TC、CC基因型与肝癌发病风险之间没有统计学关联(TC vs.TC:OR=0.95,95%CI:0.71-1.27;CC vs.TT:OR=0.77,95%CI:0.53-1.12);与mLST8基因rs26865位点野生纯合子AA基因型相比,AG、GG基因型与肝癌发病风险之间没有统计学关联(AG vs.AA:OR=0.97,95%CI:0.73-1.29;GG vs.AA:OR=1.37,95%CI:0.94-1.99);以RPTOR基因rs3751934位点CC基因型做参比,CA或者AA基因型与肝癌发病风险之间无统计学关联(CA vs.CC:OR=0.97,95%CI:0.74-1.26;AA vs.CC:OR=0.77,95%CI:0.51-1.16);分别与RPTOR基因rs3751935、 rs3751932位点TT基因型比较,其各自TC基因型或者突变纯合子CC基因型与肝癌发病风险之间无统计学关联(rs3751935:TC vs.TT:OR=1.14,95%CI:0.85-1.52;CC vs.TT:OR=0.99,95%CI:0.69-1.41;rs3751932:TC vs.TT:OR=1.12,95%CI:0.84-1.50;CC vs.TT:OR=0.89,95%CI:0.38-2.09);以RPTOR基因rs12602885位点GG基因型做参比,GA或者AA基因型与肝癌发病风险之间无统计学关联(GAvs.GG:OR=0.83,95%CI:0.63-1.08;AAvs.GG:OR=0.86,95%CI:0.49-1.50)。上述8个SNP位点在显性模型和隐性模型下均未发现差异有统计学意义。(3)联合作用分析根据以上对单个SNP位点与肝癌发病风险关联性分析的结果,将OR>1对应的基因型假设为危险基因型(简称危险基因型);若OR小于1,则以突变纯合子作为参照组,重新计算OR值后以OR>1对应的基因型为假设危险基因型。发现携带3-7个危险基因型的个体罹患肝癌的风险是携带0-2个危险基因型个体的1.53倍(95%CI:1.12-2.10)。(4)分层分析及交互作用分析以携带0-2个危险基因型的个体为参照,在汉族、无吸烟史、无饮酒史、HBV感染人群中,携带3-7个危险基因型个体患肝癌的风险分别增加49%、76%、53%、87%(汉族:OR=1.49,95%CI:1.03–2.17;无吸烟史:OR=1.76,95%CI:1.20-2.58、无饮酒史:OR=1.53,95%CI:1.05–2.22、HBV感染:OR=1.87,95%CI:1.23-2.85),但是并未发现年龄、性别、民族、吸烟史、饮酒史、HBV感染等因素与危险基因型有交互作用(P>0.05)结论本研究中,mTOR基因rs2536和rs1883965位点、mLST8基因rs3160、rs26865位点以及RPTOR基因rs1062935、rs3751932、rs3751934、rs12602885位点中,未发现单个SNP位点多态性与肝细胞癌发病风险有统计学关联,但是上述8个SNP位点的危险基因型联合作用可能增加个体罹患肝细胞癌的发病风险。
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