GRK6基因多态性与乳腺癌遗传易感性的研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zcxwlh
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目的:G蛋白偶联受体激酶(G protein-coupled receptor kinases,GRKs)可使被激活的G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors,GPCRs)发生磷酸化,从而影响细胞内外的信号传导,广泛参与机体生理活动。G蛋白偶联受体激酶6(G protein-coupled receptor kinases6,GRK6)是GRKs家族成员,越来越多的研究表明,GRK6与多种肿瘤的发生、侵袭和转移密切相关,并且在不同的肿瘤间发挥不同的作用。然而关于GRK6与乳腺癌的研究几乎未见报道,因此本研究拟探讨GRK6基因的三个位点rs1130857、rs2545796、rs335433的基因多态性与乳腺癌遗传易感性的关系。方法:本研究共纳入研究对象555例,按照组织病理学诊断为乳腺癌的纳入乳腺癌组,共190例;诊断为乳腺良性瘤的纳入乳腺良性组,共161例;再选取同时期的健康体检者作为对照组,共204例。收集研究对象的全血标本进行DNA提取,然后经PCR扩增和纯化后再用SNa Pshot测序法对产物的GRK6基因的三个位点rs1130857、rs2545796和rs335433进行基因多态性检测,同时用一代普通测序法(Sanger)对检测结果进行验证。采用拟合优度χ2检验对三个位点进行哈迪-温伯格(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE)检验。用卡方检验来统计各组间基因型和等位基因的分布差异。采用二元Logistic回归校正年龄后,计算出比值比(Odds ratio,OR)和95%置信区间(Confidential Interval,CI)和P值,分析三个位点的单核苷酸多态性(SNP)与乳腺癌遗传易感性的关系。使用在线软件SHEsis构建GRK6基因三个位点的单倍体,分析其与乳腺癌遗传易感性的关系。结果:1、本次研究纳入乳腺癌组190例,平均年龄(48.23±9.36)岁;乳腺良性瘤组161例,平均年龄(39.43±11.11)岁;健康对照组204例,平均年龄(44.87±9.46)岁。三个研究组的GRK6基因的三个位点rs1130857、rs2545796和rs335433的基因型分布均符合哈-温平衡(P>0.05),本研究的样本具有群体代表性。2、GRK6基因三个位点rs1130857、rs2545796和rs335433的基因型和等位基因频率在各组间的分布比较(1)位点rs1130857有GG、CG、CC三种基因型,乳腺癌组的基因型频率为GG(57.89%)、CG(33.68%)、CC(8.42%),乳腺良性瘤组的基因型分布频率为GG(54.04%)、CG(34.78%)、CC(11.18%),对照组的基因型分布频率为GG(53.43%)、CG(42.67%)、CC(3.92%)。等位基因在各组间的分布频率为乳腺癌组G(74.74%)、C(25.26%),乳腺良性瘤组G(71.43%)、C(28.57%),对照组G(74.75%)、C(25.25%)。三组间的基因型频率和等位基因频率进行两两比较,与对照组相比,乳腺癌组的基因型和等位基因的分布无统计学差异(P=0.058,P=0.995);与乳腺良性瘤组相比,乳腺癌组的基因型和等位基因的分布无统计学差异(P=0.623,P=0.324);与对照组相比,乳腺良性瘤组的基因型分布有统计学差异(P=0.018),等位基因分布无统计学差异(P=0.313)。(2)位点rs2545796有AA、AG、GG三种基因型,乳腺癌组的基因型频率为AA(52.63%)、AG(38.95%)、GG(8.42%),乳腺良性瘤组的基因型分布频率为AA(54.04%)、AG(34.78%)、GG(11.18%),对照组的基因型分布频率为AA(53.43%)、AG(42.16%)、GG(4.41%)。等位基因在各组间的分布频率为乳腺癌组A(72.11%)、G(27.89%),乳腺良性瘤组A(71.43%)、G(28.57%),对照组A(74.51%)、G(25.49%)。三组间的基因型频率和等位基因频率进行两两比较,与对照组相比,乳腺癌组的基因型和等位基因的分布无统计学差异(P=0.252,P=0.446);与乳腺良性瘤组相比,乳腺癌组的基因型和等位基因的分布无统计学差异(P=0.570,P=0.843);与对照组相比,乳腺良性瘤组的基因型分布有统计学差异(P=0.033),等位基因分布无统计学差异(P=0.351)。(3)位点rs335433有AA、AG、GG三种基因型,乳腺癌组的基因型频率为AA(79.48%)、AG(13.68%)、GG(6.84%),乳腺良性瘤组的基因型分布频率为AA(72.67%)、AG(16.77%)、GG(10.56%),对照组的基因型分布频率为AA(68.63%)、AG(26.96%)、GG(4.41%)。等位基因在各组间的分布频率为乳腺癌组A(86.32%)、G(13.68%),乳腺良性瘤组A(81.06%)、G(18.94%),对照组A(82.11%)、G(17.89%)。三组间的基因型频率和等位基因频率进行两两比较,与对照组相比,乳腺癌组的基因型分布有统计学差异(P=0.004),等位基因分布无统计学差异(P=0.106);与乳腺良性瘤组相比,乳腺癌组的基因型和等位基因的分布无统计学差异(P=0.288,P=0.059);与对照组相比,乳腺良性瘤组的基因型分布有统计学差异(P=0.010),等位基因分布无统计学差异(P=0.15)。3、采用Logistic回归分析对年龄因素进行校正后,分析GRK6基因三个位点rs1130857、rs2545796和rs335433的基因模型、显性模型、隐性模型和等位基因模型与乳腺癌患病风险的相关性。(1)在rs1130857位点中,以基因型GG为参照,杂合子模型(CG vs GG)、纯合子模型(CC vs GG);以GG为参照的显性模型(CG+CC vs GG);以GG+CG为参照的隐性模型(CC vs GG+CG);以等位基因G为参照的等位基因模型(C vs G)。在乳腺癌组与对照组的比较中杂合子模型(P=0.124)、纯合子模型(P=0.127)、显性模型(P=0.344)、隐性模型(P=0.065)、等位基因模型(P=0.981)均与乳腺癌患病风险无明显相关性。在乳腺癌组与乳腺良性组的比较中杂合子模型(P=0.615)、纯合子模型(P=0.565)、显性模型(P=0.521)、隐性模型(P=0.636)、等位基因模型(P=0.493)均与乳腺癌患病风险无明显相关性。在乳腺良性瘤组与对照组的比较中杂合子模型(P=0.205)、纯合子模型(P=0.053)、显性模型(P=0.605)、等位基因模型(P=0.583)均与乳腺良性瘤患病风险无明显相关性,而隐性模型(P=0.024)与乳腺良性瘤患病风险具有相关性。(2)在rs2545796位点中,以基因型AA为参照,杂合子模型(AG vs AA)、纯合子模型(GG vs AA);以AA为参照的显性模型(AG+GG vs AA);以AA+AG为参照的隐性模型(GG vs AA+AG);以等位基因A为参照的等位基因模型(G vs A)。在乳腺癌组与对照组的比较中杂合子模型(P=0.718)、纯合子模型(P=0.120)、显性模型(P=0.903)、隐性模型(P=0.096)、等位基因模型(P=0.450)均与乳腺癌患病风险无明显相关性。在乳腺癌组与乳腺良性组的比较中杂合子模型(P=0.669)、纯合子模型(P=0.757)、显性模型(P=0.800)、隐性模型(P=0.671)、等位基因模型(P=0.996)均与乳腺癌患病风险无明显相关性。在乳腺良性瘤组与对照组的比较中杂合子模型(P=0.218)、纯合子模型(P=0.090)、显性模型(P=0.584)、等位基因模型(P=0.665)均与乳腺良性瘤患病风险无明显相关性,而隐性模型(P=0.044)与乳腺良性瘤患病风险具有相关性。(3)在rs335433位点中,以基因型AA为参照,杂合子模型(AG vs AA)、纯合子模型(GG vs AA);以AA为参照的显性模型(AG+GG vs AA);以AA+AG为参照的隐性模型(GG vs AA+AG);以等位基因A为参照的等位基因模型(G vs A)。在乳腺癌组与对照组的比较中纯合子模型(P=0.510)、隐性模型(P=0.295)、等位基因模型(P=0.112)均与乳腺癌患病风险无明显相关性,而杂合子模型(P=0.002)、显性模型(P=0.016)与乳腺癌患病风险具有相关性。在乳腺癌组与乳腺良性组的比较中杂合子模型(P=0.404)、纯合子模型(P=0.226)、显性模型(P=0.191)、隐性模型(P=0.265)、等位基因模型(P=0.095)均与乳腺癌患病风险无明显相关性。在乳腺良性瘤组与对照组的比较中纯合子模型(P=0.093)、显性模型(P=0.260)、等位基因模型(P=0.968)均与乳腺良性瘤患病风险无明显相关性,而杂合子模型(P=0.026)、隐性模型(P=0.043)与乳腺良性瘤患病风险具有相关性。4.使用SHEsis软件对GRK6基因三位点rs1130857、rs2545796和rs335433进行单倍体构建发现各实验组均包括CGA、CGG、GAA、GAG、GGA、GGG、CAA、CAG八种单倍体构型,其中单倍体CGG可能与乳腺良性瘤转变乳腺癌具有相关性(P=0.015),其余单倍体与乳腺癌患病风险无相关性。结论:1、GRK6基因位点rs1130857的基因型分布频率与乳腺良性瘤患病风险具有相关性,隐性模型CC可能会增加乳腺良性瘤的患病风险。2、GRK6基因位点rs2545796的基因型分布频率与乳腺良性瘤患病风险具有相关性,隐性模型GG可能会增加乳腺良性瘤的患病风险。3、GRK6基因位点rs335433的基因型分布频率与乳腺良性瘤、乳腺癌患病风险具有相关性;杂合子模型AG、显性模型AG+GG可能会增加乳腺癌的患病风险;隐性模型GG、杂合子模型AG可能会增加乳腺良性瘤的患病风险。4、GRK6基因三位点rs1130857、rs2545796和rs335433构建的单倍体CGG可能会增加乳腺良性瘤转变乳腺癌的风险。
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