抗病毒药物与蛋白的相互作用及分子模拟

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近些年以来,由于病毒感染引起的疾病越来越常见,并且流行广,不易控制,严重危害了人们的生命健康。但是由于抗病毒类药物的发展较慢,对抗病毒类药物的认识还不充分,病毒对抗病毒药也容易产生耐药性,所以加强对抗病毒类药物的研究是非常必要的。因此本文选取了三种抗病毒类药物(法匹拉韦、维帕他韦、伯克匹韦)对它们进行了研究。人血清白蛋白是人体血浆中主要的转运蛋白,胰蛋白酶相当于是伯克匹韦的靶蛋白,所以研究这三种药物与人血清白蛋白的相互作用,伯克匹韦与胰蛋白酶的相互作用,在临床、药效和药物设计等方面都具有非常重要的意义。同时结合了三维定量构效关系(3D-QSAR)为伯克匹韦系列抗丙型肝炎病毒类药物的设计合成提供参考。研究内容分为三部分:(1)用多种光谱法和分子对接技术对法匹拉韦和维帕他韦与人血清白蛋白的相互作用机理进行了研究。结果表明,它们与人血清白蛋白是形成了复合物的静态猝灭。都存在着单一的结合位点。维帕他韦与人血清白蛋白之间是以氢键和疏水作用力结合在HSA的IIB区域,法匹拉韦与人血清白蛋白之间是以氢键与范德华力结合在HSA中siteI的IIA里。(2)用多种光谱法和分子对接技术研究了伯克匹韦与人血清白蛋白和胰蛋白酶之间的相互作用并进行了比较。结果表明:伯克匹韦与人血清白蛋白以及与胰蛋白酶都是生成复合物的静态猝灭,都存在单一的结合位点,作用力类型也相同,结合在HSA中siteI的IIA里。且伯克匹韦与它的靶蛋白类似物胰蛋白酶的结合要比与人血清白蛋白的结合更紧密。(3)采用与伯克匹韦具相同母核的一系列丝氨酸蛋白酶抑制剂进行3D-QSAR研究,寻找抑制剂化合物的结构信息与抑制受体蛋白活性之间的关系,设计出了11个新的结构的化合物,它们对丝氨酸蛋白酶具有更高抑制活性,可以为抗丙型肝炎病毒新药的设计提供参考。
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