蛋白质质谱高通量分析平台的建立及其在子宫内膜异位症中的应用性研究

被引量 : 0次 | 上传用户:PhilippsWang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
盆腔子宫内膜异位症(endometriosis, EM)是一种常见的妇女良性疾病,指异位子宫内膜累及盆腔腹膜及(或)盆腔内生殖器的病变,即子宫内膜腺体及间质细胞生长在子宫腔以外的部位,这种组织学上完全良性的内膜组织可像恶性肿瘤一样增生、浸润、扩散与转移,引起相应的临床症状。其常见的症状包括:痛经,性交痛,不孕,肠道或泌尿道症状(排便困难、腹泻、便秘、甚至周期性便血、尿频、血尿等)等,严重影响育龄期女性的生活质量和健康。子宫内膜异位症的发病机制至今仍不清楚,目前尚无有效的早期筛查和特异的诊断方法。如何提高子宫内膜异位症的诊断率尤其是早期诊断率已被公认为是改善其疗效和预后的关键。若能提高早期子宫内膜异位症的诊断率,即可明显提高子宫内膜异位症的总体治疗效果。因此,在无症状人群中用非侵入性手段筛检子宫内膜异位症,达到早发现、早诊断、早治疗,是子宫内膜异位症的重要防治策略之一。由于是蛋白质并不是核酸方为生命活动具体的执行者和体现者,因此,深入研究子宫内膜异位症的发病机制,寻找特异性、灵敏性均佳的生物标志物用于诊断,尤其是早期诊断,客观上要求在蛋白质组的水平上进行深入的探索。表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometry, SELDI-TOF-MS)是近年来发展起来的一种全新的蛋白质组学的研究手段,该方法相对其他传统的蛋白质组学研究方法而言,具有能直接对临床的标本进行检测,实现了高通量的质谱技术应用于临床样本检测的优点。生命科学的快速发展使人们从基因组学、蛋白质组学等研究领域中获得了大量的数据,仅依靠传统的统计手段是无法处理这些数据的,生物信息学的发展更是为收集、存储以及分析这些数据,并且从中获取有用的生物学信息提供了重要的手段。课题旨在应用SELDI蛋白质指纹图谱和生物信息学技术从血清、在位子宫内膜、腹水中筛选子宫内膜异位症的生物标志物并分别构建子宫内膜异位症的血清、在位子宫内膜、腹腔液诊断模型,为探索子宫内膜异位症发病机制提供新思路。第一部分子宫内膜异位症患者血清蛋白质指纹图谱模型的临床意义用SELDI—TOF—MS技术和H4蛋白芯片检测36例子宫内膜异位症和30例正常女性的血清蛋白质指纹图谱,随机抽取其中2/3的血清标本(24例子宫内膜异位症和20例正常女性血清标本)作为训练组,并建立诊断模型。然后,将余下的1/3的血清标本(12例子宫内膜异位症患者样本和10名健康人血清标本)作为实验组,进行交叉验证该模型。筛选出5个有明显表达差异的蛋白,其质荷比(m/z)分别为8142、5640、5847、8940和3269。我们建立的诊断模型对子宫内膜异位症检测的灵敏度为91.7%(11/12),特异性为90.0%(9/10),总准确率为90.9%(20/22)。第二部分子宫内膜异位症血清蛋白质质谱标准化分析平台的验证本研究在第一部分的36例子宫内膜异位症患者血清标本中随机抽选16例作为研究对象,3个月后用H4蛋白质芯片对上述16例子宫内膜异位症样本和16例健康志愿者总共32份血清标本再次进行检测,本研究严格按照第一部分的血清蛋白质质谱标准化实验方法。将前后两次结果进行对比,分析,比较两次不同时间实验选择的作为诊断模型的蛋白质峰的值,结果发现统计差异显著的峰在两次不同时间检测中都仍然差异显著,能够重复出来,而且各个不同的峰在两次不同时间的检测中在子宫内膜异位症患者和健康人血清中表达高低也能够重复,验证了子宫内膜异位症血清诊断模型的有效性。第三部分子宫内膜异位症患者在位子宫内膜指纹图谱模型的临床意义用SELDI—TOF—MS技术和H4蛋白芯片检测13例子宫内膜异位症和13例良性妇科疾病并排除子宫内膜异位症的患者的在位子宫内膜组织蛋白质指纹图谱,我们优化选择了5个蛋白质荷比峰作子宫内膜异位症在位内膜的诊断模型:6898 m/z、5891 m/z、5385 m/z、6448 m/z和5425 m/z。其中6898m/z、5891m/z和6448 m/z的3个峰在子宫内膜异位症患者在位内膜中表达高于对照组在位内膜;而5385m/z和5425m/z的2个蛋白质峰在子宫内膜异位症患者在位内膜中表达则低于对照组在位内膜。第四部分子宫内膜异位症患者腹水指纹图谱模型的临床意义用SELDI—TOF—MS技术和H4蛋白芯片检测14例子宫内膜异位症和16例对照组的腹水蛋白质指纹图谱,我们优化选择了4个蛋白质荷比峰作子宫内膜异位症腹水的诊断模型:4428m/z、6891m/z 13766m/z和6427m/z。其中4428m/z、6427m/z的2个峰在子宫内膜异位症患者腹水中高表达;13766m/z和6891m/z的2个蛋白质峰在子宫内膜异位症患者腹水中则低表达。结论:5个蛋白质峰8142m/z、5640m/z、5847m/z、8940m/z和3269m/z组合所构建的血清诊断模型鉴别子宫内膜异位症和健康志愿者的总准确率为90.9%(20/22)。其中5640m/z、5847m/z、和3269 m/z的3个峰在子宫内膜异位症患者血清中高表达;8142m/z和8940m/z的2个蛋白质峰在子宫内膜异位症患者血清中则低表达。本研究建立的的标准方法建立的模型在样本的不同时间上有效性和重复性均得到了验证。5个蛋白质峰6898 m/z、5891 m/z、5385 m/z、6448 m/z和5425 m/z组合构建了子宫内膜异位症的在位子宫内膜的诊断模型。其中6898m/z、5891m/z和6448 m/z在子宫内膜异位症中高表达,5385m/z和5425m/z在子宫内膜异位症中低表达。4个蛋白质峰4428m/z、6891m/z 13766m/z和6427m/z组合构建了子宫内膜异位症的腹水的诊断模型。其中4428m/z、6891m/z在子宫内膜异位症腹水中高表达,13766m/z和6427m/z在子宫内膜异位症腹水中低表达。
其他文献
为实现对航运集装箱作业全过程的追踪管理,各航运公司纷纷建立起航运集装箱物流信息管理系统,形成对集装箱物流业务的科学化、信息化管理。由于海内外相互独立的信息系统,具有地
增强现实技术(Augmented Reality,,简称AR)是把虚拟的物体叠加到现实世界的图像上,实现人与虚拟物体的交互,这些虚拟物体可以是文字,图片,3D模型或视频等等。ARToolKit是一套
介绍了数学形态学的基本运算以及形态滤波和多分辨形态学梯度技术。分析了小电流接地系统中发生单相接地故障时零序电流的暂态特征。应用形态滤波和多分辨形态学梯度技术对零
中国国有银行在改革过程中经历层层蜕变,终于转变为独立经营的股份制商业银行。建立有效的银行价值评估体系,是中国国有股份制商业银行业务拓展与经营发展的当务之急。中国国
今年1-6月份,全国钛白粉行业(不含钛矿)持续低迷,但是梧州藤县钛白粉产量突破6.7万吨,增长11.9%,钛白工业总产值达到7.91亿元.藤县位于西江之畔,钛矿贮藏量大、品位高,含量在45%-
前言银屑病(psoriasis)是在多基因遗传背景下发生的以T细胞为主的多种免疫细胞共同参与的慢性复发性皮肤病,典型皮损为鳞屑性红斑。目前认为银屑病的发病机制主要表现为由T细
给出了一种利用暂态量分析和故障录波技术的分散式新型选线装置的设计。该分散式设计的采集单元回路采用多CPU架构为每路出线回路采集信号,中央控制单元采用PC104或80C51F,它
本文提出一种基于小波变换与αβ空间参数提取小电流接地系统单相接地故障特征的方法来实现单相接地故障选线。利用小波变换对线路电流和电压的暂态信息进行处理,提取暂态量
在我国发展中,财务会计与税收会计存在一定差异,主要因为税收会计工作目的就是保证实收业务信息的准确性,避免出现偷税漏税的现象,而财务会计是利用科学的计量方式,对经济效
在彝族悠长的历史发展中,舞蹈艺术永远伴随着彝族人民生活的转变而成长与发扬。艺术形式的演变往往揭示着一个民族社会的进化状态,而舞蹈艺术恰好最能充分展示一个民族的基本