草鱼呼肠孤病毒逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法的建立

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:grnjade
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
草鱼(Ctenopharyngodon idellus)是我国主要的淡水养殖品种,具有生长速度快、饲料来源广、养殖成本低、味道鲜美等优点,深受养殖者与消费者欢迎。但草鱼易患多种疾病,严重阻碍了草鱼养殖业的发展。草鱼出血病是养殖草鱼鱼种阶段最为严重的传染性疾病,其病原为草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV),给草鱼养殖业带来了巨大损失。草鱼出血病流行范围广、发病季节长,传播速度快,发病率与死亡率高,且治疗方法有限,只能以防为主,因此,建立草鱼出血病的快速检测方法对草鱼健康养殖具有十分重要的意义。环介导等温扩增(Loop-mediatedisothermal amplification,LAMP)技术是一种新型的核酸体外扩增技术。该技术不需要变温过程,在Bst聚合酶的作用下恒温即可进行反应,操作简单且扩增率高,特异性强,在LAMP的基础上,只需加入逆转录酶即可完成对RNA的一步法逆转录环介导等温扩增(Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification,RT-LAMP)。   针对GCRV104株的S8节段序列(HM234682.2)设计特异性引物,对RT-LAMP扩增反应温度、反应时间、Mg2+浓度、Betaine浓度、dNTPs浓度、引物浓度等反应条件进行了优化,建立了GCRV的RT-LAMP检测方法,并对结果观察方法、反应灵敏度和特异性等进行了初步评价,在此基础上用建立的RT-LAMP方法对疑似患草鱼出血病的草鱼样本进行了检测。研究结果表明,扩增反应时间、Mg2+浓度、引物浓度是影响LAMP扩增的关键因素,其中最佳扩增时间为60 min,最佳Mg2+浓度为6 mmol/L,最佳引物浓度为内引物1.6μmol/L,外引物0.2μmol/L。其它条件对RT-LAMP扩增反应的影响较小。该方法具有良好的特异性,检测限为33 pg病毒核酸,灵敏度比RT-PCR法高10倍,与斑点叉尾鮰呼肠孤病毒(CRV)、鲤鱼春季病毒血症病毒(SVCV)、锦鲤疱疹病毒(KHV)及大鲵虹彩病毒(GSIV)等无交叉反应。采用琼脂糖凝胶电泳方法与SYBR Green I荧光染色法观察草鱼呼肠孤病毒RT-LAMP检测的结果,两种观察方法的灵敏度一致。采用本研究建立的方法对疑似患出血病草鱼进行检测,结果为阳性。   本研究建立的GCRV RT-LAMP检测方法特异性强,灵敏度高,操作简便,结果易判断,适合草鱼呼肠孤病毒的现场检测,对草鱼出血病的快速诊断与有效防控具有实际应用价值。
其他文献
植食性昆虫的天敌能够利用虫害诱导的挥发物进行有效的寄主或猎物定位.为了开发稻飞虱卵期天敌稻虱缨小蜂Anagrus nilaparvatae Pang et Wang的引诱剂,分别在室内和室外检测
期刊
从小,我就是一个暗地的着魔者.我总是在各种纬度的,阴暗的墙角里爬行,寻找墙壁上渗水的缝隙以及所有的可能性,就像一只退化成蜥蜴的鳄鱼.这是悲伤的,或者我自觉悲伤.
写下这个题目,想起的是秦牧两本散文集的名字,《语林采英》和《艺海拾贝》--在丰富和广大里选萃、撷英,我的“桂林一枝”,就算套用这个意思吧,不是有“桂林、桂林,桂树成林”
小时候,喜欢玩捉人游戏,一种是藏在缝隙中,让人来捉;另一种不藏,是在圈定的距离内奔跑着捉.rn一两条巷,三五间屋,八九十个玩童,躲藏的范围是事先约定好了的.大人说,没有规矩
一rn“咿--好厚的霜哦!”起早的人,踏着霜经过我家小楼侧面的巷子,去挖甘蔗了.rn是在乡间,星期天,一醒来就听见夹杂着感叹与担忧的脚步声纷至沓来.心里清楚,霜一重,就会有东
这一次出走,离我三十岁的年龄已差不了一些了,但我还是想出去走走,这会使我想起十年前的事情.rn那时我送一个心爱的人回家,我却不敢进她的村庄.我只能远远地看见她一点点地隐
本文研究了鸡肉粉、肉骨粉单一蛋白源,以及鸡肉粉和发酵豆粕,肉骨粉和发酵豆粕复合蛋白源在军曹鱼饲料中替代鱼粉的应用情况。分别设计了四个等氮等能的实验,用这四种单一或
(一)rn其实养在城里的动物要比乡下的多.rn城里并没有乡下的那种饲养处,便只能把发廊、酒吧腾出来养着.
今年的冬天还是如往常一样来了.rn冬天是无情的,它不管你是绅士还乞丐,它都会在一定的时候冲着你过来,你这一辈子也必须经历接连不断的冬天,在它要到来时候,不论你怎么躲也躲