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分析甘肃省手足口病流行特征及病原学特征,为制定有效的防控策略提供依据。采用描述性流行病学分析方法对甘肃省手足口病发病资料进行分析,采集的病例临床标本用RT-PCR或Real-time PCR法检测肠道病毒(Human enterovirus,HEV)核酸,用RD和HEp-2细胞分离病毒,阳性病毒株采用RT-PCR方法扩增全长VP1编码区后,进行核苷酸序列测定和分析。结果表明2008~2012年共报告手足口病病例52 550例,包括重症病例205例,死亡病例27例。5年全省发病率依次为22.42/10万、49.29/10万、47.20/10万、27.27/10万和55.84/10万,全省14个市州均有发病,兰州市发病数最高为16 001例,占全省病例的30.45%,发病集中在5~7月,占全年病例的51.69%,男女性别比为1.69∶1,其中5岁以下儿童发病占87.59%。对5 416例病例标本进行了实验室检测,HEV核酸阳性3 322例(阳性率61.34%),其中肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV 71)占46.96%,柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CVA16)占41.57%,其他HEV占11.47%。对186例重症病例进行实验室检测,HEV核酸阳性114例(阳性率61.29%),其中EV 71占82.46%;对25例死亡病例进行实验室检测,均为EV71感染。从3 111份临床标本(咽拭子2123份,粪便705份,疱疹液705份)分离到病毒402株,其中EV71占70.15%,CVA16占27.11%,其它柯萨奇A组病毒占3.98%,柯萨奇B组病毒占2.49%,埃可病毒占1.74%,腺病毒占1.99%。流行HEV的基因型分析结果显示,2008~2012年分离到的194株EV71均为C4基因亚型的C4a进化分支;45株CVA16均为B1基因亚型,其中12株属于B1a进化分支,33株属于B1b进化分支,2012年B1b已成优势亚型。结论是甘肃省手足口病在5岁以下儿童感染率最高,主要病原为EV 71和CVA16,发病率随感染病原型别的不同呈现波浪形变化,不同病原呈现交替流行的现象,重症和病死病例与EV71感染密切相关,同一年度不同地区的病原型别存在差异。