【摘 要】
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采用16SrDNA高通量测序方法研究猪舍空气微生物的多样性。实验采用Illumina MiSeq 2×250系统,对细菌16S rDNA(V4)区进行测序;采用QIIME软件对数据进行分析。结果表明:猪舍空
【机 构】
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四川农业大学动物遗传育种与繁殖研究所;
【基金项目】
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生猪产业技术体系四川创新团队建设项目(SZCXTD-2);教育部长江学者和创新团队发展计划(RT13083)
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采用16SrDNA高通量测序方法研究猪舍空气微生物的多样性。实验采用Illumina MiSeq 2×250系统,对细菌16S rDNA(V4)区进行测序;采用QIIME软件对数据进行分析。结果表明:猪舍空气微生物多样性丰富,基于97%的相似规律来确定OTU(operational taxonomical unit),其中,有16种门、115种科、217种属被鉴定;在属水平上,10种优势菌群是Pseudomonas、Acinetobacter、Streptococcus、Lactococcus、Enhydrobacter、Lactobacillus、Chryseobacterium、Wautersiella、Flavobacterium、Leuconostoc,其中,6种被报道为病原微生物。实验结果表明,了解猪舍空气微生物的多样性、丰度及优势菌群的病原性对猪舍疾病防控有一定指导意义。
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