目的对上海市2004至2005年新诊断的114例人类免疫缺陷病毒I型(HIV-I)感染者进行分子流行病学调查,为确定上海市流行的HIV-1的分子生物学特征提供监测依据。方法应用逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1多聚酶基因,DNA测序后进行进化系统树分析确定基因亚型并与国际耐药数据库比对辨别耐药性突变位点。结果1．114例中除1例不详外,本市户口33例,占28．95％,外来人口80例,占70．18％；经性传播感染51例,占44．74％,经静脉注射吸毒感染43例,占37．72％,经采供血和输血感染3例,占2．63％,感染途径不详17例,占14．91％；2．基因亚型分别为B亚型9例,占7．89％,B′亚型15例,占13．16％,C亚型1例,占0．88％,G亚型1例,占0．88％,CRF01-AE 38例,占33．33％,CRF07 BC46例,占40．35％和CRF08 BC 4例,占3．51％；3．耐药分析结果表明本次研究人群的耐药性主突变率为18．42％。与蛋白酶抑制剂(PRIs)和逆转录酶抑制剂(RTIs)耐药相关的基因主突变率分别为2．63％(3/114)和17．54％(20/114)。蛋白酶基因主突变位点突变频率为M461,占66．67％．M46L,占33．33％。逆转录酶基因主突变位点突变频率分别为M41L,占7．69％、A62V．占7．69％、F69S．占7．69％、V751/L,占15．38％、K103R,占25．00％、V1181．占23．08％、V179D/E/T,占33．33％、G190R,占8．33％、L210K／M／X,占38．46％、F227L／I,占16．67％、M230R,占8．33％和P236R,占8．33％。结论上海市新诊断的HIV-1感染者依然以静脉吸毒和性传播为主,感染者以外省市流动人门为主。HIV-1基因亚型流行呈多样性,主要以CRF01_AE,CRF07_BC和B/B’为主。在114例新诊断、尚未经抗病毒治疗的HIV-1感染者中,已存在与PRIs和RTIs耐药相关的基因主突变。