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目的:为处理医疗机构廉价基本药物短缺问题提供建议。方法:结合医疗机构廉价基本药物短缺的现状,分析其产生的原因。结果:医疗机构廉价基本药物短缺的主要原因在于作为理性经济人的医疗机构不使用廉价基本药物、医师处于博弈优势地位、医药企业的合理利润没有保障、医疗保险支付方式存在缺陷。结论:政府应明确负责处理廉价基本药物短缺问题的行政机构,加大对廉价基本药物的投入,保障医药企业生产、配送廉价基本药物的合理利润,同时完善医疗保险制度。