基于间隙模式的并发序列模式挖掘算法

来源 :沈阳化工大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：mvcexq

【摘要】

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在研究并发序列模式和带间隙约束的模式匹配方法基础上,提出间隙模式的概念,并设计基于间隙模式的并发序列模式挖掘算法PBcon.该算法借鉴已有的基于支持量机制,首先挖掘2-分

【作者】

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杨梦涛王翠青陈未如

【机构】

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沈阳化工大学计算机科学与技术学院

【出处】

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沈阳化工大学学报

【发表日期】

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2019年2期

【关键词】

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并发序列模式生物序列模式挖掘间隙约束间隙模式

【基金项目】

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辽宁省科技攻关基金项目(2012219001);辽宁省教育厅科技基金项目(L2013157)

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在研究并发序列模式和带间隙约束的模式匹配方法基础上,提出间隙模式的概念,并设计基于间隙模式的并发序列模式挖掘算法PBcon.该算法借鉴已有的基于支持量机制,首先挖掘2-分支的并发间隙模式,然后逐步生成3-分支、4-分支及更多分支的并发间隙模式.用真实蛋白质数据对算法进行验证,并与已有的蛋白质相关算法比较,PBcon算法在挖掘效率和挖掘质量上都较有优势.

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