利用SNP分子标记构建50份糯玉米自交系DNA指纹库

来源 :上海农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：LuYang

【摘要】

：

为构建糯玉米品种DNA指纹库,保护品种资源,利用Illumina公司研发的包含56110个SNP标记的芯片,对50份糯玉米自交系进行基因分型。结果表明:按照SNP标记选用标准,共得到42406个

【作者】

：

韩晴孙小淋卢媛田东施标沈雪芳

【机构】

：

上海市农业科学院作物育种栽培研究所,上海市农业科学院生态环境保护研究所

【出处】

：

上海农业学报

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

糯玉米自交系 DNA指纹库 SNP标记 Waxy cornInbred lineDNA Fingerprint databaseSNP marker

【基金项目】

：

上海市市级农口系统青年人才成长计划[沪农青字(2018)第1-6号],上海市鲜食玉米产业技术体系[沪农科产字(2019)第10号],上海市科学技术委员会科研计划项目(17391902702、153919N1300),上海市农业科学院卓越团队项目(农科创2017B-08),2019上海市农业科学院青年科技人员“助跑”计划,上海市科技支撑项目(17391900100),科技部重点研发项目(2018YF

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

为构建糯玉米品种DNA指纹库,保护品种资源,利用Illumina公司研发的包含56110个SNP标记的芯片,对50份糯玉米自交系进行基因分型。结果表明:按照SNP标记选用标准,共得到42406个SNP标记。这些标记的杂合率均值为0.04,SNP缺失率均值为0.01,最小等位基因频率(MAF)均值为0.4,多态性信息含量(PIC)均值为0.38,基因多样性指数均值为0.44。对上述获得的SNP标记设置不同数量位点进行筛选,确定25000位点为核心标记位点,可用于构建糯玉米自交系DNA指纹库。在25000位点

其他文献

大兴安岭发展林下经济现状与措施

大兴安岭地区林下经济前景广阔，潜力巨大，并关系到该区能否成功的实现林业经济转型。因而，如何整合林下资源，因势利导的推进全区林下经济的协调发展，成为发展林下经济的关键所在。

期刊

大兴安岭林下经济现状建议Daxin＇ganling area undergrowth economy current status suggesti

语文学科培养创新能力三谈

一、找准启发点,调动学生思维的积极性学生的学习过程是一种情感过程,究其实质,是人类认识客观事物的一个紧缩过程.使学生参与求知的全过程,要落实在教学的每一个环节.

期刊

语文学科情感过程学生参与创新能力学生思维培养学习过程实在客观事物求知

抗日战争大事记

1.1931年9月18日，日本在沈阳制造事端，在3个多月里占领东北全境，3000万东北同胞沦为日军铁蹄下的奴隶。　　2.1932年1月28日，日军制造事端，中国军民死伤1.6万余人。　　3.1932年3月，日本扶植成立伪“满洲国”。　　4.1935年11月，日本唆使汉奸殷汝耕拼凑“冀东防共自治委员会”，使冀东22个县沦为日本殖民地。　　5.1936年12月12日，爱国将领张学良、杨虎城发动西安事变

期刊

中国电信FDD 4G VoLTE业务异常事件分析处理的研究

本文介绍了衡水电信网优团队运用SEQ平台系统排查、网管信令跟踪、VoLTE感知平台等工具手段,通过日常用户投诉问题处理和主动发现、分析并解决异常事件,展开对VoLTE现网的接

期刊

VoLTEIMSSEQVOBBSBC

应答器THR和TFFR分配及SIL等级探讨

CENELEC最新发布的欧洲标准EN50129-2018增加了TFFR概念,对危害的THR和功能的TFFR做了进一步的解释和说明。本文从THR及TFFR的分配出发,借鉴ETCS中欧标应答器的THR分配,并结

期刊

应答器可容忍危害发生率可容忍功能失效率安全完整性等级BaliseTHRTFFRSIL

新时代财经类独立学院计算机专业改革实践探索

本科教育是高等教育之本,专业建设是本科教育之魂,新时代对本科专业建设提出了新的更高要求。教育部新近颁布了关于实施一流本科专业建设“双万计划”的通知,江苏省教育厅也

期刊