高粱花叶病毒广西甘蔗分离物全基因组序列分析

来源 :广西甘蔗学会第十届代表大会暨2015年学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:rockman27
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近年来,高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus,SrMV)已成为危害广西甘蔗的主要病原病毒,但尚未见侵染本地区甘蔗的SrMV全基因组序列的报道.本研究以田间一株感染SrMV的甘蔗为材料,提取叶片总RNA,通过RT-PCR及RACE技术扩增获得9626nt(不包括polyA尾)的病毒全长基因组序列,命名为SrMV-GX.序列分析表明,SrMV-GX与浙江萧山分离物(SrMV-XoS)、浙江余杭分离物(SrMV-YH)和美国德克萨斯州分离物(SrMV-H)的核苷酸同源性分别为95.4%、94.7%和80.9%;编码的多聚蛋白氨基酸同源性分别为97.8%、98.4%和90.4%.与马铃薯Y病毒科的其它成员一样,SrMV-GX基因组中存在一个小的ORF(pretty interesting potyviridae ORF,pipo),且其序列非常保守.本研究对SrMV-GX进行序列分析,为进一步研究SrMV的遗传多样性,改进现有的检测方法及培育健康脱毒甘蔗种苗提供理论依据.
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