【摘 要】
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为了明确青稞与燕麦镰孢菌在转录水平上的互作,以抗病青稞NQK-01-03和感病青稞甘青2号为材料,以IlluminaHiSeqXten为平台,对抗感病青稞在接菌前、接菌20d和40d后茎基部的转录
【机 构】
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甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃省农业科学院植物保护研究所,甘肃省农业科学院林果花卉研究所
【基金项目】
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国家公益性行业专项(201503112);国家重点研发计划(2018YFD0201100);甘肃省农业科学院科研条件建设及成果转化项目(2017GAAS73)资助
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为了明确青稞与燕麦镰孢菌在转录水平上的互作,以抗病青稞NQK-01-03和感病青稞甘青2号为材料,以IlluminaHiSeqXten为平台,对抗感病青稞在接菌前、接菌20d和40d后茎基部的转录组进行测序。结果表明:经过测序质量控制,抗感病青稞茎基部共得到112.97GbCleanData。DEGs基因表达注释共获得差异表达基因4280个,其中,上调基因2037个,下调基因2243个。通过BLAST软件与COG、GO、KEGG、KOG、NCBI-NR、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG数据库进
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