【摘 要】
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GDP-甘露糖4,6-脱水酶(GDP-mannose 4,6-dehydratase,GMD)是生物体内参与多糖合成代谢的一个重要基因.本研究利用毛竹全基因组和转录组数据信息,对GMD基因家族进行细致分析,
【机 构】
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浙江农林大学,省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,杭州,311300;浙江农林大学林业与生物技术学院,杭州,311300
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GDP-甘露糖4,6-脱水酶(GDP-mannose 4,6-dehydratase,GMD)是生物体内参与多糖合成代谢的一个重要基因.本研究利用毛竹全基因组和转录组数据信息,对GMD基因家族进行细致分析,共鉴定出39个家族成员.毛竹GMD各家族基因的理化性质有一定差异,但所含甘露糖4,6脱水酶结构域进化相对保守.进化树分析将毛竹GMD基因家族分为3大类.该家族基因上游启动子序列存在多种光响应、环境胁迫、激素应答等有关顺式作用元件.同源模建显示毛竹GMD为同源二聚体蛋白质,两个亚基均有相同或催化功能.转录组数据分析发现,部分成员GMD基因在竹笋生长阶段基因高表达特征明显,表明其可能参与笋的生长发育.另外,GMD的表达受到不同激素的影响.本研究通过对GMD基因的生物信息学分析,有利于进一步明确毛竹GMD基因的功能及其在岩藻糖生物合成途径中的作用.
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