【摘 要】
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目的 探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织与正常组织之间的差异表达基因,构建ESCC的预后相关模型并验证其临床应用价值.方法 首先,基于GSE20347、GSE23400、GSE26886、GSE45168、GSE77861数据集确定ESCC的差异表达基因.其次,经通路富集后使用STRING和Cytoscape软件筛选关键基因.随后,Kaplan-Meier Plotter和单变量Cox回归用于生存分析,多因素Cox回归应用于构建预后模型
【机 构】
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兰州大学第二医院检验医学中心,甘肃兰州 730000
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目的 探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织与正常组织之间的差异表达基因,构建ESCC的预后相关模型并验证其临床应用价值.方法 首先,基于GSE20347、GSE23400、GSE26886、GSE45168、GSE77861数据集确定ESCC的差异表达基因.其次,经通路富集后使用STRING和Cytoscape软件筛选关键基因.随后,Kaplan-Meier Plotter和单变量Cox回归用于生存分析,多因素Cox回归应用于构建预后模型.实时荧光定量PCR用于验证预后相关基因的差异表达情况.此外,我们通过Kaplan-Meier曲线、ROC曲线、一致性指数、灵敏度和特异度验证模型的预后价值.最后,利用基因集富集分析进一步探讨ESCC预后机制.结果 本研究发现98个差异表达基因和15个关键基因,其中6个关键基因与预后相关.此外,基于VCAN、ALOX12和ACPP的预后模型经验证临床应用价值较好.结论 基于VCAN、ALOX12和ACPP的预后模型可独立预测ESCC的预后.
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