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大学组织是崇高教育理想的社会建制，大学自主、大学自治是知识生产逻辑内在发展的客观要求和精神内核。20世纪80年代以来，我国大学在大学自主的改革进程中引入了市场机制，对大学组织特征、教师与学生身份认定、专业设置、学术评价、权利运行的结构等方面均产生了一些负面影响。新时期的中国大学自主要求重新界定政府职能，厘清政府与市场、社会、大学组织之间的协调与合作关系。