【摘 要】
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目的 基于分子对接技术和网络药理学探索姜黄素治疗肝癌的分子作用机制.方法 通过SuperPred、SwissTargetPrediction和NCBI、DisGeNET、GeneCards数据库分别检索姜黄素的作用
【机 构】
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陕西中医药大学,陕西 咸阳,712000;陕西中医药大学第一附属医院,陕西 咸阳,71200
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目的 基于分子对接技术和网络药理学探索姜黄素治疗肝癌的分子作用机制.方法 通过SuperPred、SwissTargetPrediction和NCBI、DisGeNET、GeneCards数据库分别检索姜黄素的作用靶点和肝癌疾病作用靶点,映射获得姜黄素治疗肝癌的潜在靶点.借助STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络,导入Cytoscape软件,按MCC计算法筛选核心靶点.将潜在靶点应用clusterProfiler R软件进行GO富集和KEGG通路分析.依托Zinc、PDB数据库获得姜黄素的分子结构及核心靶点蛋白结构,利用AutoDockTools、PyMOL软件,将二者进行预处理及分子对接.结果 通过网络数据挖掘获得姜黄素作用靶点114个,肝癌疾病靶点1560个,映射获得37个姜黄素治疗肝癌的潜在靶点;PPI网络按MCC法计算后获得10个核心靶点互作关系;通过GO富集分析获得生物过程(BP)1061条,细胞组成(CC)18条,分子功能(MF)72条;通过KEGG通路分析获得56条信号通路,主要涉及PD-L1表达和PD-1检查点通路、肿瘤中的蛋白聚糖、乙型肝炎、病毒致癌作用、肿瘤中的miRNAs等;分子对接结果显示,姜黄素与核心靶点的结合能均<0 kJ·mol-1,其中TP53、EGRF、MMP9、ESR1、HIF1A、AR与姜黄素的结合能<-5 kJ·mol-1,结合活性显著.结论 基于分子对接技术及网络药理学初步揭示姜黄素以多靶点、多通路、多生物学功能等特点发挥对肝癌的治疗作用,为后续研究提供了理论基础.
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