【摘 要】
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采用生物信息学的研究方法,应用一系列工具软件分析研究钝顶螺旋藻Fts Z蛋白,以认识钝顶螺旋藻Fts Z蛋白一级和二级结构,并为进一步研究该蛋白空间结构和功能机制奠定理论基
【基金项目】
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文山学院科研基金项目“真核与原核生物细胞骨架蛋白的同源建模比对分析及系统进化关系研究”(11WSY01)
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采用生物信息学的研究方法,应用一系列工具软件分析研究钝顶螺旋藻Fts Z蛋白,以认识钝顶螺旋藻Fts Z蛋白一级和二级结构,并为进一步研究该蛋白空间结构和功能机制奠定理论基础。获得钝顶螺旋藻Fts Z蛋白一级结构相关理化参数的详细数据,预测蛋白二级结构,对蛋白的3D结构进行了同源建模、质量评价分析。研究结果表明钝顶螺旋藻Fts Z蛋白是一种酸性蛋白,主要定位于细胞核区;蛋白二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋两种结构组成;同源建模后得到的3D模型在空间构象上有较高的合理性,其中模型A有100%氨基酸残基数落于Ramachandran图的允许区,该模型含有14个α-螺旋结构,5个βα-β单位,2个β-折叠结构,1个β-发夹结构,16个β-转角和1个γ-转角。
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