牛大力淀粉酶基因家族的生物信息学分析

来源 :广西植物 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yongleyu

【摘要】

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该文基于不膨大和膨大的牛大力根的转录组测序结果,采用生物信息学技术对筛选到的28个牛大力淀粉酶基因进行分析。结果表明:28个牛大力淀粉酶相关蛋白基因编码的氨基酸序列分

【作者】

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涂冬萍王柳萍赵立春黄志其翟勇进白隆华莫长明

【机构】

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广西中医药大学,广西壮瑶药工程技术中心,广西中医药大学农作物废弃物功能成分研究协同创新中心,广西药用植物园,广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

【出处】

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广西植物

【发表日期】

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2020年9期

【关键词】

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牛大力转录组淀粉酶基因家族理化特性 Millettia speciosatranscription groupamylase gene familyphy

【基金项目】

：

广西自然科学基金项目(2017GXNSFBA198094),广西教育厅中青年教师基础能力提升项目(2017KY495),广西中医药大学校级科研项目(2016QN013),杨世林教授团队人才培养建设项目(YSL17026),广西中医药大学中药学优势学科建设专项课题,广西农作物废弃物功能成分研究协同创新中心项目(CICAR 2016-P4),广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2018JZ3)

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该文基于不膨大和膨大的牛大力根的转录组测序结果,采用生物信息学技术对筛选到的28个牛大力淀粉酶基因进行分析。结果表明:28个牛大力淀粉酶相关蛋白基因编码的氨基酸序列分子量为20.78~349.39 KDa;均为酸性蛋白部分;部分亚细胞定位在叶绿体;具有PLN02784 super family、AmyAc-family super family结构域;二级结构中除MsAm1、MsAm7、MsAm8、MsAm15、MsAm16、MsAm22、MsAm23、MsAm28中α螺旋占比最大外,无规则卷曲的比例最大

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