红薯收获后，窖藏管理是关键。入窖后要保持适宜温度，薯块在储藏期间的适宜温度为10～14℃，低于9℃则易受害，高于15℃则呼吸作用旺盛，会使薯块发芽、重量减轻、品质下降。根據薯块的特点和天气变化，对薯窖的管理可分为三个阶段。
　　1.前期。薯块入窖初期以通风、降温、散湿为主。因为刚入窖时外界气温高，薯块呼吸强度大，会放出大量的水汽、二氧化碳和热量，致使窖内温度升高、湿度增大。这就给薯块发芽、感染病害创造了条件，尤其是带病的薯块由于病菌侵染蔓延，造成薯块大量腐烂，俗称“烧窖”。如果温度适宜，薯块只会发芽不会腐烂。在薯块入窖30天内要经常注意窖内温度、湿度的变化，加以调剂。入窖5～7天内为了促使伤口愈合，窖温保持在15～18℃，注意不要使窖温上升到20℃以上；入窖5～7天后，窖温不要超过15℃，最好控制在12～14℃，相对湿度保持在85%～90%。
　　2.中期。薯块入窖后30天至来年立春前后，以保温防寒为主。这个阶段气温低，薯块呼吸强度弱，放出热量小，是薯块最容易遭受冷害的时期。注意当窖温下降到12～13℃时，就要开始保温。如封闭窖口与通气孔，在薯堆上盖干草或草苫（兼防冷凝水浸湿薯块，以防受湿害）；如严冬窖温降低到9～10℃时，视窖温应适当加热增温。
　　3.后期。立春至出窖前，气温逐渐回升，但天气变化无常，时有寒流。由于薯块长期储藏，呼吸作用微弱，抵抗力减弱，经不起窖温过大的变化，受不了低温的侵袭。所以应随时注意天气变化，及时调整窖口与通气口大小，以保持窖内温度在12～14℃，相对湿度在85%～90%。