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研究了两个接收站输出信号的频率有差异时的时延估计问题并针对广义相关时延估计提出了改进方法。首先理论推导了频率差异是如何影响广义相关时延估计的,接着应用频域相关函数对频差做准确估计和补偿,最后给出了频差补偿后的广义相关时延估计方法。以四种常用通信信号为例,仿真验证了不同信噪比下提出方法的正确性和有效性。