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蛋白质loop区域闭合数值方法分析与比较
蛋白质loop区域闭合数值方法分析与比较
来源 :软件导刊 | 被引量 : 0次 | 上传用户:linxuekai
【摘 要】
:
针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下
【作 者】
:
孙路
吕强
徐维维
权丽君
【机 构】
:
苏州大学计算机科学与技术学院,江苏省计算机信息处理技术重点实验室
【出 处】
:
软件导刊
【发表日期】
:
2013年8期
【关键词】
:
蛋白质
loop区域闭合
数值方法
循环坐标下降法
雅可比矩阵
Protein
Loop Region Closure
Numerical Method
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针对蛋白质loop区域的闭合问题,比较分析了两种来源于机器人学的数值方法——循环坐标下降法(CCD)和雅可比矩阵方法,进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法,而雅可比矩阵方法则可以较平均地改变每一个二面角值。
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