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冬季用显微镜镜检患有疫病的棉铃种籽，能检查到棉铃疫菌的游动孢子囊或卵孢子；重病棉铃种籽所带的卵孢子比轻病棉铃种籽多。疫病占整铃面积１／４以上时，其中的种籽可分离到疫菌；疫病在铃面的面积较小时，在其种籽上未分离到疫菌。将疫病棉铃中的自然带病种籽、健铃种籽与疫菌混合，或土中接种疫菌后播种，都能在铃期表现烂铃，烂铃数比播种健铃种籽多；但８月少雨时，种籽带菌对铃期烂铃影响不明显。疫菌在５５℃５分钟即死亡；