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对硕士研究生学制由三年调整为两年过程中存在的问题进行了探讨。提出通过课程改革，开设研究型课程，将研究生自主学习能力、写作能力、研究能力、实践能力和团队精神的培养部分前移到课程教学中，以此弥补“三改二”后硕士研究生课题研究时间缩短、研究能力训练和综合素质培养不足的问题。以“工程数字信号处理算法与实践”课程为例，介绍了“基于项目的协作学习模式”在两年制硕士研究生课程教学改革中的运用方法和应用成效。