马传染性贫血病毒驴白细胞弱毒疫苗gag基因的序列测定及分析

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以马传染性贫血病毒(EIAV)驴白细胞弱毒疫苗株(DLA)病毒基因组RNA为材料,用RT-PCR方法扩增出EIAV gag基因,经平端连接将其克隆到质粒载体pUC19中.由于疫苗不是克隆株,因此通过5次单独克隆与测序,推导出EIAV-DLA gag基因的优势序列.gag基因全长1 458个碱基,编码一486个氨基酸残基的前体蛋白.与美国EIAV Wyoming 1369株比较,核苷酸同源性为80%,氨基酸同源性为84.47%.其中,衣壳蛋白P26的主要同源区(MHR)、核衣壳蛋白P11的两个CCHC型锌指结构及酸性蛋白P9的YXXL基元为高度保守的结构.为进一步研究马传染性贫血病毒弱毒疫苗的致弱机理提供了理论依据.
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