利用小波变换的一种快速预测基因方法

来源 :生物数学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wuchen112

【摘要】

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三周期性是大多数基因组序列的编码区所具有的主要特征.本文提出只计算1/3频率点的傅里叶频谱的快速计算方法,并用它分析DNA序列的三周期性,再利用小波变换在一定尺度下滤波

【作者】

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王玉

【机构】

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西南科技大学信息工程学院

【出处】

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生物数学学报

【发表日期】

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2008年2期

【关键词】

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功率谱离散傅立叶变换小波变换基因预测 Power spectrum analysis Discrete Fourier Transform Wavelet

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三周期性是大多数基因组序列的编码区所具有的主要特征.本文提出只计算1/3频率点的傅里叶频谱的快速计算方法,并用它分析DNA序列的三周期性,再利用小波变换在一定尺度下滤波来实现对DNA序列编码区的预测.理论分析和大量计算机实验证实了方法的有效性,预测效果良好.该方法运算快速,不需要任何训练组,也不依赖于现有数据库的信息.

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