基于质谱的BLAST方法在金鱼胚胎蛋白质鉴定中的应用

来源 :中国生物化学与分子生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wlcbgtxx

【摘要】

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未知基因组及蛋白质序列数据库有限的物种的蛋白质组学分析是当前一些非模式生物物种蛋白质组学研究领域的瓶颈之一.基于同源性搜索的BLAST方法（MS BLAST）,是近年新发展起来的

【作者】

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张玲徐东陈锋菊谢锦云梁宋平

【机构】

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湖南师范大学生命科学学院

【出处】

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中国生物化学与分子生物学报

【发表日期】

：

2006年8期

【关键词】

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基质辅助激光解吸飞行时间串联质谱从头测序磺基异硫氰酸苯酯基于质谱的BLAST方法蛋白质组学 MALDI-TOF/TOF de novo sequenc

【基金项目】

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国家自然科学基金项目（No.90408017）致谢：感谢本论文完成过程中曹锐老师和李水明师弟给予的帮助.

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未知基因组及蛋白质序列数据库有限的物种的蛋白质组学分析是当前一些非模式生物物种蛋白质组学研究领域的瓶颈之一.基于同源性搜索的BLAST方法（MS BLAST）,是近年新发展起来的一种用于未知基因组的蛋白质鉴定的搜索工具,已成功应用于许多未知基因组物种的蛋白质鉴定.SPITC化学辅助方法是本实验室建立的一种改进的de novo质谱测序方法.采用MS BLAST方法对经Mascot软件数据库搜索未能鉴定到的19个金鱼胚胎蛋白质进行鉴定,其中12个蛋白质是直接测序后进行MS BLAST搜索得到的结果,另外7个蛋

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