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详细考察了基于HNP（H：hydrophobic，N：neutral，P：hydrophilic）模型及相对熵的蛋白质设计方法对于不同结构类型蛋白质的适用性，并与基于HP模型的结果进行了比较.通过对190个4种不同结构类型的蛋白质进行预测，结果表明，基于HNP模型及相对熵的设计方法对于不同结构类型的蛋白质具有普适性.进一步的研究发现，对于α螺旋、β折叠等规则的二级结构，该方法的预测成功率高于无规卷曲结构预测成功率.另外，还比较了对不同氨基酸的预测差异，结果显示亲水残基的预测成功率较高.此外，研究表明该方法