【摘 要】
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为了获得红白锦鲤的基因组信息,筛选与其肤色相关的基因,采用Illumina高通量测序技术对红白锦鲤皮肤组织的基因组进行测序,获得127.23 Gb clean data,Q20碱基比例在95.59%及
【机 构】
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北京市水产科学研究所暨国家淡水渔业工程技术研究中心,农业部都市农业(北方)重点实验室,渔业生物技术北京市重点实验室,中国农业大学
【基金项目】
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北京市财政局、北京市农业农村局观赏鱼产业技术体系北京市创新团队建设专项(编号:BAIC03);北京市农林科学院项目(编号:KJCX20170101)
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为了获得红白锦鲤的基因组信息,筛选与其肤色相关的基因,采用Illumina高通量测序技术对红白锦鲤皮肤组织的基因组进行测序,获得127.23 Gb clean data,Q20碱基比例在95.59%及以上,Q30碱基比例在90.81%及以上,GC含量为37.32%~42.38%,测序错误率为0.07。与鲤鱼基因组序列进行比对的结果显示,比对效率为96.35%。研究共鉴定了1048576个SNPs(单核苷酸多态性),其中3.12百万~5.40百万个SNPs位于短reads比对不到的区域,其中变异位点位于外显
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