铜绿假单胞菌噬菌体PaP3基因组的初步注释

来源 :第三军医大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hxffxh2009

【摘要】

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目的对已完成测序的铜绿假单胞菌噬菌体PaP3基因组进行初步注释.方法利用生物信息学软件和网上工具对噬菌体PaP3进行开发阅读框(Open reading frame,ORFs)检索;编码序列鉴定;

【作者】

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张克斌金晓琳朱军民胡晓梅饶贤才胡福泉

【机构】

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第三军医大学基础医学部微生物学教研室

【出处】

：

第三军医大学学报

【发表日期】

：

2002年4期

【关键词】

：

噬菌体基因组一级注释铜绿假单胞菌 bacteriophage PaP3 genome annotation

【基金项目】

：

国家自然科学基金，重庆市科技攻关项目

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目的对已完成测序的铜绿假单胞菌噬菌体PaP3基因组进行初步注释.方法利用生物信息学软件和网上工具对噬菌体PaP3进行开发阅读框(Open reading frame,ORFs)检索;编码序列鉴定;对公共数据库进行BLAST查询,分析基因的可能功能;对存在高度同源性序列的推定蛋白进行多重序列比对和系统发生树分析.结果利用生物信息学软件在PaP3基因组中检索到252个大于100 bp的ORFs, 其中有69个ORFs可确认为推定基因;核苷酸对核苷酸的BLASTn分析未发现有意义的同源性核苷酸序列;核苷酸对蛋白

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