梅花鹿抗病毒蛋白的生物信息学分析

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通过在线生物软件分析梅花鹿四种抗病毒蛋白A3Z2、BST-2A、BST-2B和SAMHD1蛋白的生物信息学特性。从转录组中获得四种蛋白的基因序列,应用ProtParam、Protscale、SOPMA、TMHMM、TargetP、SignalP、MotifScan、Interproscan以及BLAST等在线软件分析蛋白的理化性质、二级结构、穿膜域、结构域等等。首次获得了四种抗病毒因子的基因和蛋白序列,梅花鹿A3Z2基因编码393个氨基酸,相对分子质量为47.59 kDa,碱性,不稳定性亲水蛋白,无信号肽
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