基于加权模糊k近邻方法的蛋白质亚细胞位点预测

来源 :中国生物医学工程学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jenjen1985

【摘要】

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蛋白质只有在特定的亚细胞位点（如细胞核、线粒体、细胞质等）才能参与正常的生命活动，因此蛋白质的哑细胞定位信息对于了解其功能有重要的意义。提出一种应用于蛋白亚细胞定位的

【作者】

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马翔王明会李骜谢丹冯焕清

【机构】

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中国科学技术大学电于科学与技术系

【出处】

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中国生物医学工程学报

【发表日期】

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2006年1期

【关键词】

：

模糊k近邻投票算法亚细胞定位生物信息学 weighted fuzzy K-NN subcellular localization machine lear

【基金项目】

：

中国科学院知识刨新工程重大项目.

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蛋白质只有在特定的亚细胞位点（如细胞核、线粒体、细胞质等）才能参与正常的生命活动，因此蛋白质的哑细胞定位信息对于了解其功能有重要的意义。提出一种应用于蛋白亚细胞定位的多模糊k近邻加权投票算法。使用PSI-BLAST搜索得到的PSSM矩阵，以及1～7阶氨基酸对的信息作为输入特征，分别建立了8个模糊k近邻分类器，最后对所有分类器的结果使用加权投票得到最终预测结果。对包含四类亚细胞位置的RH-2427数据集进行jacknife测试，总预测精度达到88．1％，好于包括单一模糊k近邻在内的多种其它预测方法。同时，该

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