烟草叶绿体基因组RNA编辑位点的鉴定与分析

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RNA编辑是指在RNA水平发生的碱基的改变或修饰。RNA编辑现象普遍存在于植物等多种生物体中,且在细胞核、线粒体和叶绿体中均有发生。为了更好了解烟草叶绿体基因组中RNA编辑位点的数量及它们发挥的功能,本研究借助烟草3种器官(叶, 花, 根)的基因组测序数据及RNA测序数据,对烟草叶绿体基因组里胞嘧啶(C)转换为尿嘧啶(U)的RNA编辑位点进行了鉴定。在烟草叶绿体基因组中,发现了1 002个RNA编辑位点。609个编辑位点位于63个蛋白编码基因,占所有编辑位点的60.8%,其中无义突变的编辑位点46个。蛋白编码基因中,rpoC2、ycf1和ndhD发生的编辑位点最多,RNA基因中trnG、trnfM和trnD有最多的编辑位点。对叶、花和根中的编辑位点进行比较,根有652个RNA编辑位点,是3种器官中最多的。这些无义突变的RNA编辑位点,在花、根中主要是影响参与光合作用的基因,而在叶中这些基因未受影响。表明RNA编辑作为转录后调控的一种方式,对于维持不同器官的功能是非常重要的。本研究为进一步研究烟草RNA编辑的生物学功能提供帮助。
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