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用活体观察法对迄今缺乏了解的麦积山肉鞭类原生动物的物种多样性进行了调查，共鉴定出水生肉鞭虫100种，包括2个未知种。鞭毛亚门（Mastigophora）有2纲9目15科31属59种。植鞭纲（Phytomastigophorea）有52种，其中眼虫目（Euglenida）36种，占鞭毛虫物种总数的61．02％，为优势类群；动鞭纲（zoomastigophorea）仅有7种，没有明显的优势类群。肉足亚门（Sarcodina）有4纲6目19科32属41种。叶足纲（Lobosea）有31种，其中变形目（Amoeb