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"双一流"政策背景下我国行业性院校面临着学科生态环境的衰变,诸如与行业的协同度消退;学科生态结构的耗散,学科贡献度降低;学科生态对人才的涵养能力减弱等。行业性院校的学科生态治理应遵循竞争性与可持续性、多样性与层级性发展、包容性与协同性的基本逻辑,构建与行业产业共生共荣的学科创新型生态,以一流学科建设为目标建立学科生态治理机制,优化学科治理结构以激发学科创新能力。