【摘 要】
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基因芯片以其高通量、微型化和自动化等优点成为医学基因诊断的重要工具,芯片探针的设计和筛选是制备高质量基因芯片关键步骤之一。目前,已有不少探针设计软件被开发出来,它
【机 构】
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中南大学地球科学与信息物理学院生物医学工程系;
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(60801019,61371042);中南大学中央高校基本科研业务费专项资金资助(2013zzts252)
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基因芯片以其高通量、微型化和自动化等优点成为医学基因诊断的重要工具,芯片探针的设计和筛选是制备高质量基因芯片关键步骤之一。目前,已有不少探针设计软件被开发出来,它们针对不同的设计对象,显示出各自的优势和局限性。本文聚焦寡核苷酸探针筛选设计的三个基本标准,即特异性、敏感性和熔点(Tm),介绍了探针设计软件研究发展状况。结合文献报道,对软件的用途进行分类说明。本综述将有助于用户快速选择合适的软件用于探针设计,对降低芯片制备成本、提高芯片应用研究效率、促进高性能的探针设计软件研究及商品化具有重要的意义。
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