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国家公益性行业科研专项经费自2006年启动至今已经3年，虽然管理办法中明确规定要开展公益性行业科研经费的绩效考评工作，但目前仍处在摸索之中。本文根据环保公益性行业科研专项项目绩效考评的探索和实践，研究并提出了项目绩效考评工作的内容、指标和流程，同时探讨了在绩效考评工作中应当注意的问题，以供其他公益性行业科研专项在今后绩效考评工作中参考借鉴。