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在脱氧核糖核酸修理的一个基本问题是损害怎么被检测是否在百万～十亿正常盐基对嵌入。广泛的结构、功能的研究表明脱氧核糖核酸的原子细节修理蛋白质和 nucleic 相互作用。这评论总结在损害识别使用的看起来多样的结构的主题并且建议一般机制由叠的差的底认出脱氧核糖核酸损害。在损害的这个分享的结构的特征的起始的识别以后，不同脱氧核糖核酸修理小径使用唯一的确认机制保证正确损害鉴定和移动。