红系细胞发育相关miR-196b的靶基因预测及意义

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：gaolch005

【摘要】

：

目的预测红系细胞发育相关miR-196b的靶基因，并探讨其作用机制。方法应用miRbase数据库查找多物种已知的miR-196b成熟序列，比对后分析其在多物种间的保守性。应用miRanda、miRD

【作者】

：

丁谨刘芳胡彩艳施继禹

【机构】

：

青海大学医学院

【出处】

：

山东医药

【发表日期】

：

2016年48期

【关键词】

：

红系细胞 miR-196b 靶基因生物信息学 erythroid cells miR-196b target genes bioinformatics

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目的预测红系细胞发育相关miR-196b的靶基因，并探讨其作用机制。方法应用miRbase数据库查找多物种已知的miR-196b成熟序列，比对后分析其在多物种间的保守性。应用miRanda、miRDB、Targetscan7．1、PI-TA和miRWalk数据库对miR-196b的靶基因进行预测，筛选重复率较高的靶基因。应用Cytoscape3．3．0和KEGG对重复率较高的靶基因进行GO分类富集分析和信号通路富集分析。查阅文献，再次筛选与红系细胞发育相关的靶基因，采用Targetscan7．1和RNA2

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