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高校协同创新需要多方参与、多方协同,本身是一个复杂的系统工程.在高校协同创新过程中,欲达到系统创新的可持续发展状态,使各方抱有强烈的意愿加入协同创新主体,长效的协同创新激励机制的建立是必不可少的,而激励不足是建立长效的激励机制面对的主要问题.本文主要从高校的激励收益水平、政府的有效支持及对科研人员的激励方式等七个方面分析了建立长效协同创新激励机制的影响因素.